Как использовать агентные инструменты биологии
Инструменты биологии покрывают лабораторную работу, которую агент может автоматизировать: секвенирование, культуру клеток, микроскопию, подготовку сред, биобанк, цитометрию, иммуноанализы, биопроцесс и чтения оборудования. Они комбинируются по случаю, и образец проходит нужную цепочку: попадает в биобанк, готовятся среда и культура, выполняется секвенирование, запускается ПЦР или электрофорез, делается снимок под микроскопом, и результат сопоставляется с репозиторием; это тот же маршрут, который проходит робот, когда пипетирует и перемещает планшеты внутри лаборатории, и если что-то критично, агент уведомляет группу реагирования. Каждый инструмент можно использовать с реализацией приложения, с реализацией третьей стороны или со своей, в зависимости от функциональности и доступности выбранной системы.
Инструменты, которые использует приложение, должны соответствовать схеме совместимости (API schema), чтобы подключаться; если они ей не соответствуют, они не используются. Учётные данные могут быть вашими или третьей стороны: когда их предоставляет третья сторона, их использование также подпадает под условия этой третьей стороны.
Вы можете использовать инструменты с открытым исходным кодом, разработать своими силами программистов вашей организации или заказать разработку, чтобы соединить оборудование вашей лаборатории с приложением. Ничто не привязано к поставщику: одна и та же схема служит любому, кто её соблюдает.
Как работают инструменты
Агент запрашивает инструмент, инструмент проверяет совместимость схемы, и агент выполняет его против оборудования или системы, которую вы выберете. База данных может размещаться в вашей инфраструктуре или во внешнем сервисе, и инструмент только читает или записывает то, что позволяет разрешение. Каждый вызов остаётся в журнале использования аккаунта, со временем, источником и системой; если что-то не удаётся, он возвращает ошибку и не выдумывает подтверждение.
Как использовать инструменты
BIO-T01 Секвенирование образцов
Используйте её, чтобы загрузить партию в секвенатор и следить за прогоном. Инструмент сообщает о ходе, собирает необработанные результаты с их контролем качества и регистрирует каждую выдачу.
Характеристики: загрузка партии · ход прогона · контроль качества · необработанные результаты.
BIO-T02 Культура клеток
Используйте её, чтобы настраивать инкубаторы и условия по партиям согласно протоколу. Инструмент применяет температуру, газы и время и оставляет запись каждого изменения.
Характеристики: инкубаторы · условия по партиям · протоколы · журнал изменений.
BIO-T03 Подготовка сред
Используйте её, чтобы готовить партии питательной среды по рецепту. Инструмент контролирует стерилизацию и разлив и передаёт партию с её записью.
Характеристики: базовый рецепт · стерилизация · разлив по планшетам · запись партии.
BIO-T04 Съёмка микроскопии
Используйте её, чтобы делать снимки с микроскопа и организовывать их по образцу и увеличению. Инструмент сохраняет метаданные сессии и передаёт материал готовым к анализу.
Характеристики: съёмка по образцу · увеличения · метаданные · организация.
BIO-T05 Запись биобанка
Используйте её, чтобы регистрировать образцы в биобанке с их происхождением, сохранением и местом. Инструмент оставляет прослеживаемость каждого перемещения и подтверждает регистрацию.
Характеристики: регистрация образца · сохранение · место · прослеживаемость.
BIO-T06 Результаты ПЦР
Используйте её, чтобы читать прогоны количественной ПЦР и их классификацию по образцам. Инструмент передаёт циклы, кривые и результат готовым к отчёту.
Характеристики: кривые · циклы · классификация · результаты по образцам.
BIO-T07 Электрофорез
Используйте её, чтобы собирать гели и их чтения. Инструмент извлекает полосы, веса и контроли каждого прогона и передаёт их агенту.
Характеристики: гели · полосы · веса · контроли.
BIO-T08 Подсчёт колоний
Используйте её, чтобы считать колонии по планшетам камерой или счётчиком лаборатории. Инструмент регистрирует результат по разведению и сохраняет изображение.
Характеристики: подсчёт по планшетам · разведения · запись · изображения.
BIO-T09 Запись штаммов
Используйте её, чтобы вести каталог штаммов с происхождением, пассажами и сохранением. Инструмент предупреждает, когда пора обновлять, и передаёт карточку каждого штамма.
Характеристики: каталог · пассажи · сохранение · уведомления об обновлении.
BIO-T10 Масс-спектрометрия
Используйте её, чтобы читать результаты спектрометра по образцам. Инструмент передаёт пики, массы и их интерпретацию готовыми к анализу.
Характеристики: пики · массы · интерпретация · результаты по образцам.
BIO-T11 Проточная цитометрия
Используйте её, чтобы считать и классифицировать клетки по маркеру. Инструмент прогоняет образец в цитометре и передаёт популяции и проценты.
Характеристики: популяции · маркеры · сортировка · отчёт.
BIO-T12 Экспрессия и очистка белков
Используйте её, чтобы индуцировать экспрессию и очистить нужный белок. Инструмент контролирует культуру, лизис и очистку и передаёт выход по партии.
Характеристики: индукция · лизис · очистка · выход.
BIO-T13 Ферментация в биореакторе
Используйте её, чтобы управлять биореактором по партиям. Инструмент настраивает температуру, pH и кислород и сообщает о ходе ферментации.
Характеристики: температура · pH · кислород · ход по партиям.
BIO-T14 Иммунологические анализы
Используйте её, чтобы запускать иммунологические анализы, такие как ELISA, и читать их результаты. Инструмент наносит планшет, измеряет и передаёт кривую по образцу.
Характеристики: ELISA · антитела · кривая · результаты по образцам.
BIO-T15 Полевой отбор проб
Используйте её, чтобы брать биологические образцы в поле, с их холодовой цепью и записью. Инструмент ведёт к точке отбора и передаёт идентифицированный образец в лабораторию.
Характеристики: точка отбора · холодовая цепь · идентификация · передача.
Начните сейчас
Вы можете использовать эти инструменты на natuleadan.app или на любой открытой платформе, соединяющей ваши системы. Если вы используете приложение, создайте аккаунт и свяжите свои учётные данные, чтобы ваш агент использовал их по задаче. Подробности использования: на странице цен.